Protein–RNA interactions for Protein: B5KM66

Syce3, Synaptonemal complex central element protein 3, mousemouse

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Length 88 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce3B5KM66 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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