Protein–RNA interactions for Protein: B2RUR8

Otud7b, OTU domain-containing protein 7B, mousemouse

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud7bB2RUR8 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms