Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC14□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC14□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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