Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms