Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-M5A7VMS3 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-M5A7VMS3 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-M5A7VMS3 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-M5A7VMS3 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-M5A7VMS3 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-M5A7VMS3 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-M5A7VMS3 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-M5A7VMS3 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-M5A7VMS3 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-M5A7VMS3 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-M5A7VMS3 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-M5A7VMS3 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-M5A7VMS3 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-M5A7VMS3 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-M5A7VMS3 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-M5A7VMS3 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-M5A7VMS3 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-M5A7VMS3 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-M5A7VMS3 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-M5A7VMS3 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-M5A7VMS3 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-M5A7VMS3 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-M5A7VMS3 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-M5A7VMS3 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-M5A7VMS3 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-M5A7VMS3 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms