Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
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Atp8b5A3FIN4 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp8b5A3FIN4 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp8b5A3FIN4 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp8b5A3FIN4 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp8b5A3FIN4 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp8b5A3FIN4 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp8b5A3FIN4 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp8b5A3FIN4 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp8b5A3FIN4 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp8b5A3FIN4 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp8b5A3FIN4 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp8b5A3FIN4 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp8b5A3FIN4 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp8b5A3FIN4 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp8b5A3FIN4 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Atp8b5A3FIN4 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
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Atp8b5A3FIN4 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Atp8b5A3FIN4 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp8b5A3FIN4 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp8b5A3FIN4 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Atp8b5A3FIN4 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp8b5A3FIN4 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp8b5A3FIN4 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp8b5A3FIN4 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp8b5A3FIN4 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp8b5A3FIN4 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp8b5A3FIN4 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp8b5A3FIN4 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp8b5A3FIN4 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp8b5A3FIN4 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp8b5A3FIN4 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp8b5A3FIN4 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp8b5A3FIN4 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp8b5A3FIN4 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp8b5A3FIN4 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Atp8b5A3FIN4 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp8b5A3FIN4 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Atp8b5A3FIN4 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp8b5A3FIN4 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp8b5A3FIN4 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
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