Protein–RNA interactions for Protein: A2AKB4

Frmpd1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd1A2AKB4 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Frmpd1A2AKB4 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Frmpd1A2AKB4 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Frmpd1A2AKB4 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Frmpd1A2AKB4 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Frmpd1A2AKB4 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Frmpd1A2AKB4 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Frmpd1A2AKB4 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Frmpd1A2AKB4 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Frmpd1A2AKB4 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Frmpd1A2AKB4 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Frmpd1A2AKB4 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Frmpd1A2AKB4 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Frmpd1A2AKB4 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Frmpd1A2AKB4 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Frmpd1A2AKB4 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Frmpd1A2AKB4 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Frmpd1A2AKB4 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Frmpd1A2AKB4 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Frmpd1A2AKB4 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Frmpd1A2AKB4 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Frmpd1A2AKB4 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Frmpd1A2AKB4 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Frmpd1A2AKB4 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Frmpd1A2AKB4 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Frmpd1A2AKB4 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Frmpd1A2AKB4 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Frmpd1A2AKB4 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Frmpd1A2AKB4 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Frmpd1A2AKB4 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Frmpd1A2AKB4 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Frmpd1A2AKB4 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Frmpd1A2AKB4 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Frmpd1A2AKB4 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Frmpd1A2AKB4 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Frmpd1A2AKB4 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Frmpd1A2AKB4 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Frmpd1A2AKB4 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Frmpd1A2AKB4 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Frmpd1A2AKB4 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Frmpd1A2AKB4 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Frmpd1A2AKB4 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Frmpd1A2AKB4 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Frmpd1A2AKB4 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Frmpd1A2AKB4 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Frmpd1A2AKB4 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Frmpd1A2AKB4 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Frmpd1A2AKB4 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Frmpd1A2AKB4 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Frmpd1A2AKB4 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Frmpd1A2AKB4 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Frmpd1A2AKB4 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Frmpd1A2AKB4 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Frmpd1A2AKB4 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Frmpd1A2AKB4 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Frmpd1A2AKB4 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Frmpd1A2AKB4 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Frmpd1A2AKB4 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Frmpd1A2AKB4 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Frmpd1A2AKB4 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Frmpd1A2AKB4 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Frmpd1A2AKB4 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Frmpd1A2AKB4 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Frmpd1A2AKB4 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Frmpd1A2AKB4 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Frmpd1A2AKB4 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Frmpd1A2AKB4 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Frmpd1A2AKB4 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Frmpd1A2AKB4 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Frmpd1A2AKB4 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Frmpd1A2AKB4 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Frmpd1A2AKB4 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Frmpd1A2AKB4 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Frmpd1A2AKB4 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Frmpd1A2AKB4 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Frmpd1A2AKB4 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Frmpd1A2AKB4 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Frmpd1A2AKB4 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Frmpd1A2AKB4 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Frmpd1A2AKB4 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Frmpd1A2AKB4 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Frmpd1A2AKB4 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Frmpd1A2AKB4 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Frmpd1A2AKB4 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Frmpd1A2AKB4 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Frmpd1A2AKB4 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Frmpd1A2AKB4 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Frmpd1A2AKB4 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Frmpd1A2AKB4 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Frmpd1A2AKB4 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Frmpd1A2AKB4 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Frmpd1A2AKB4 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Frmpd1A2AKB4 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Frmpd1A2AKB4 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Frmpd1A2AKB4 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Frmpd1A2AKB4 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Frmpd1A2AKB4 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Frmpd1A2AKB4 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Frmpd1A2AKB4 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Frmpd1A2AKB4 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms