Protein–RNA interactions for Protein: W8DXL4

Lrit3, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 681 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit3W8DXL4 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lrit3W8DXL4 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Lrit3W8DXL4 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lrit3W8DXL4 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lrit3W8DXL4 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lrit3W8DXL4 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lrit3W8DXL4 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lrit3W8DXL4 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lrit3W8DXL4 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lrit3W8DXL4 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lrit3W8DXL4 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lrit3W8DXL4 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lrit3W8DXL4 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lrit3W8DXL4 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lrit3W8DXL4 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lrit3W8DXL4 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lrit3W8DXL4 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lrit3W8DXL4 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Lrit3W8DXL4 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Lrit3W8DXL4 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lrit3W8DXL4 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lrit3W8DXL4 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lrit3W8DXL4 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lrit3W8DXL4 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lrit3W8DXL4 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lrit3W8DXL4 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lrit3W8DXL4 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Lrit3W8DXL4 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lrit3W8DXL4 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lrit3W8DXL4 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lrit3W8DXL4 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lrit3W8DXL4 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lrit3W8DXL4 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lrit3W8DXL4 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lrit3W8DXL4 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lrit3W8DXL4 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lrit3W8DXL4 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lrit3W8DXL4 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrit3W8DXL4 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrit3W8DXL4 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrit3W8DXL4 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrit3W8DXL4 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrit3W8DXL4 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrit3W8DXL4 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrit3W8DXL4 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrit3W8DXL4 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrit3W8DXL4 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrit3W8DXL4 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrit3W8DXL4 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrit3W8DXL4 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrit3W8DXL4 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrit3W8DXL4 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrit3W8DXL4 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrit3W8DXL4 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrit3W8DXL4 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrit3W8DXL4 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrit3W8DXL4 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrit3W8DXL4 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrit3W8DXL4 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrit3W8DXL4 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrit3W8DXL4 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrit3W8DXL4 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrit3W8DXL4 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrit3W8DXL4 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrit3W8DXL4 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrit3W8DXL4 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrit3W8DXL4 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrit3W8DXL4 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrit3W8DXL4 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrit3W8DXL4 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrit3W8DXL4 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrit3W8DXL4 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrit3W8DXL4 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrit3W8DXL4 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Lrit3W8DXL4 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Lrit3W8DXL4 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Lrit3W8DXL4 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Lrit3W8DXL4 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Lrit3W8DXL4 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Lrit3W8DXL4 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Lrit3W8DXL4 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Lrit3W8DXL4 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Lrit3W8DXL4 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Lrit3W8DXL4 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Lrit3W8DXL4 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Lrit3W8DXL4 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Lrit3W8DXL4 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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