Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Y3

Homer1, Homer protein homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer1Q9Z2Y3 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.3 ms