Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q2

Knop1, Lysine-rich nucleolar protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knop1Q9Z2Q2 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Knop1Q9Z2Q2 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Knop1Q9Z2Q2 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Knop1Q9Z2Q2 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Knop1Q9Z2Q2 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Knop1Q9Z2Q2 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Knop1Q9Z2Q2 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Knop1Q9Z2Q2 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Knop1Q9Z2Q2 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Knop1Q9Z2Q2 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Knop1Q9Z2Q2 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Knop1Q9Z2Q2 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Knop1Q9Z2Q2 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Knop1Q9Z2Q2 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Knop1Q9Z2Q2 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Knop1Q9Z2Q2 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Knop1Q9Z2Q2 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Knop1Q9Z2Q2 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Knop1Q9Z2Q2 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Knop1Q9Z2Q2 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Knop1Q9Z2Q2 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Knop1Q9Z2Q2 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Knop1Q9Z2Q2 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Knop1Q9Z2Q2 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Knop1Q9Z2Q2 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Knop1Q9Z2Q2 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Knop1Q9Z2Q2 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Knop1Q9Z2Q2 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Knop1Q9Z2Q2 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Knop1Q9Z2Q2 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Knop1Q9Z2Q2 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Knop1Q9Z2Q2 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Knop1Q9Z2Q2 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Knop1Q9Z2Q2 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Knop1Q9Z2Q2 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Knop1Q9Z2Q2 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Knop1Q9Z2Q2 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Knop1Q9Z2Q2 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Knop1Q9Z2Q2 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Knop1Q9Z2Q2 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Knop1Q9Z2Q2 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Knop1Q9Z2Q2 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Knop1Q9Z2Q2 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Knop1Q9Z2Q2 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Knop1Q9Z2Q2 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Knop1Q9Z2Q2 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Knop1Q9Z2Q2 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Knop1Q9Z2Q2 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms