Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X4

Ilf3, Interleukin enhancer-binding factor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ilf3Q9Z1X4 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ilf3Q9Z1X4 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ilf3Q9Z1X4 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ilf3Q9Z1X4 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ilf3Q9Z1X4 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ilf3Q9Z1X4 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ilf3Q9Z1X4 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ilf3Q9Z1X4 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ilf3Q9Z1X4 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ilf3Q9Z1X4 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ilf3Q9Z1X4 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ilf3Q9Z1X4 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ilf3Q9Z1X4 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ilf3Q9Z1X4 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ilf3Q9Z1X4 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ilf3Q9Z1X4 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ilf3Q9Z1X4 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ilf3Q9Z1X4 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ilf3Q9Z1X4 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ilf3Q9Z1X4 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ilf3Q9Z1X4 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ilf3Q9Z1X4 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ilf3Q9Z1X4 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ilf3Q9Z1X4 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ilf3Q9Z1X4 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ilf3Q9Z1X4 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ilf3Q9Z1X4 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ilf3Q9Z1X4 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ilf3Q9Z1X4 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ilf3Q9Z1X4 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ilf3Q9Z1X4 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ilf3Q9Z1X4 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ilf3Q9Z1X4 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ilf3Q9Z1X4 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ilf3Q9Z1X4 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ilf3Q9Z1X4 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ilf3Q9Z1X4 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ilf3Q9Z1X4 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ilf3Q9Z1X4 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ilf3Q9Z1X4 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ilf3Q9Z1X4 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ilf3Q9Z1X4 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ilf3Q9Z1X4 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ilf3Q9Z1X4 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ilf3Q9Z1X4 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ilf3Q9Z1X4 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ilf3Q9Z1X4 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ilf3Q9Z1X4 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ilf3Q9Z1X4 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ilf3Q9Z1X4 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ilf3Q9Z1X4 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ilf3Q9Z1X4 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ilf3Q9Z1X4 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ilf3Q9Z1X4 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ilf3Q9Z1X4 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ilf3Q9Z1X4 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ilf3Q9Z1X4 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ilf3Q9Z1X4 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ilf3Q9Z1X4 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ilf3Q9Z1X4 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ilf3Q9Z1X4 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ilf3Q9Z1X4 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ilf3Q9Z1X4 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ilf3Q9Z1X4 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ilf3Q9Z1X4 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ilf3Q9Z1X4 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ilf3Q9Z1X4 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ilf3Q9Z1X4 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Ilf3Q9Z1X4 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Ilf3Q9Z1X4 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ilf3Q9Z1X4 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ilf3Q9Z1X4 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ilf3Q9Z1X4 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ilf3Q9Z1X4 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ilf3Q9Z1X4 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ilf3Q9Z1X4 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ilf3Q9Z1X4 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ilf3Q9Z1X4 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ilf3Q9Z1X4 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ilf3Q9Z1X4 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ilf3Q9Z1X4 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ilf3Q9Z1X4 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ilf3Q9Z1X4 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ilf3Q9Z1X4 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ilf3Q9Z1X4 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ilf3Q9Z1X4 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ilf3Q9Z1X4 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ilf3Q9Z1X4 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ilf3Q9Z1X4 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ilf3Q9Z1X4 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ilf3Q9Z1X4 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ilf3Q9Z1X4 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ilf3Q9Z1X4 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ilf3Q9Z1X4 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ilf3Q9Z1X4 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ilf3Q9Z1X4 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ilf3Q9Z1X4 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ilf3Q9Z1X4 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ilf3Q9Z1X4 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ilf3Q9Z1X4 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms