Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUU8

Tnip1, TNFAIP3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnip1Q9WUU8 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118.6 ms