Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E1

Plod3, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod3Q9R0E1 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.1 ms