Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

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Length 511 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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