Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS8

Sh2d3c, SH2 domain-containing protein 3C, mousemouse

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Length 854 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d3cQ9QZS8 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh2d3cQ9QZS8 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh2d3cQ9QZS8 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh2d3cQ9QZS8 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh2d3cQ9QZS8 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh2d3cQ9QZS8 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh2d3cQ9QZS8 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh2d3cQ9QZS8 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh2d3cQ9QZS8 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh2d3cQ9QZS8 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh2d3cQ9QZS8 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh2d3cQ9QZS8 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh2d3cQ9QZS8 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh2d3cQ9QZS8 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh2d3cQ9QZS8 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh2d3cQ9QZS8 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh2d3cQ9QZS8 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh2d3cQ9QZS8 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh2d3cQ9QZS8 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh2d3cQ9QZS8 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh2d3cQ9QZS8 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh2d3cQ9QZS8 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sh2d3cQ9QZS8 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sh2d3cQ9QZS8 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sh2d3cQ9QZS8 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sh2d3cQ9QZS8 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh2d3cQ9QZS8 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh2d3cQ9QZS8 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sh2d3cQ9QZS8 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
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