Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Gm12106-201ENSMUST00000116006 1200 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 4930412F09Rik-201ENSMUST00000139006 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms