Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Gm27227-201ENSMUST00000183413 633 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 E330011O21Rik-205ENSMUST00000211317 1062 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 AC124742.1-201ENSMUST00000219909 547 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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SrfQ9JM73 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Gm32877-201ENSMUST00000197419 709 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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