Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF6

Tgm1, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase K, mousemouse

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm1Q9JLF6 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tgm1Q9JLF6 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tgm1Q9JLF6 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tgm1Q9JLF6 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tgm1Q9JLF6 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tgm1Q9JLF6 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tgm1Q9JLF6 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tgm1Q9JLF6 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tgm1Q9JLF6 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tgm1Q9JLF6 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tgm1Q9JLF6 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tgm1Q9JLF6 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tgm1Q9JLF6 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tgm1Q9JLF6 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tgm1Q9JLF6 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tgm1Q9JLF6 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tgm1Q9JLF6 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tgm1Q9JLF6 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tgm1Q9JLF6 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tgm1Q9JLF6 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tgm1Q9JLF6 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tgm1Q9JLF6 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tgm1Q9JLF6 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tgm1Q9JLF6 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tgm1Q9JLF6 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tgm1Q9JLF6 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tgm1Q9JLF6 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tgm1Q9JLF6 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tgm1Q9JLF6 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tgm1Q9JLF6 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tgm1Q9JLF6 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tgm1Q9JLF6 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tgm1Q9JLF6 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tgm1Q9JLF6 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tgm1Q9JLF6 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tgm1Q9JLF6 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tgm1Q9JLF6 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms