Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP7

Pole3, DNA polymerase epsilon subunit 3, mousemouse

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole3Q9JKP7 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pole3Q9JKP7 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pole3Q9JKP7 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pole3Q9JKP7 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pole3Q9JKP7 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pole3Q9JKP7 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Pole3Q9JKP7 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pole3Q9JKP7 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pole3Q9JKP7 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pole3Q9JKP7 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pole3Q9JKP7 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pole3Q9JKP7 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pole3Q9JKP7 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pole3Q9JKP7 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pole3Q9JKP7 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pole3Q9JKP7 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pole3Q9JKP7 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pole3Q9JKP7 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pole3Q9JKP7 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pole3Q9JKP7 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pole3Q9JKP7 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pole3Q9JKP7 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pole3Q9JKP7 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pole3Q9JKP7 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pole3Q9JKP7 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pole3Q9JKP7 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pole3Q9JKP7 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pole3Q9JKP7 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Pole3Q9JKP7 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pole3Q9JKP7 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pole3Q9JKP7 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pole3Q9JKP7 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pole3Q9JKP7 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pole3Q9JKP7 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pole3Q9JKP7 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pole3Q9JKP7 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pole3Q9JKP7 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pole3Q9JKP7 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pole3Q9JKP7 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pole3Q9JKP7 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pole3Q9JKP7 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pole3Q9JKP7 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pole3Q9JKP7 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pole3Q9JKP7 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pole3Q9JKP7 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pole3Q9JKP7 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pole3Q9JKP7 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pole3Q9JKP7 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pole3Q9JKP7 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pole3Q9JKP7 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pole3Q9JKP7 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pole3Q9JKP7 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pole3Q9JKP7 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pole3Q9JKP7 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pole3Q9JKP7 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pole3Q9JKP7 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pole3Q9JKP7 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pole3Q9JKP7 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pole3Q9JKP7 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pole3Q9JKP7 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pole3Q9JKP7 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pole3Q9JKP7 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pole3Q9JKP7 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pole3Q9JKP7 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pole3Q9JKP7 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pole3Q9JKP7 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pole3Q9JKP7 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pole3Q9JKP7 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pole3Q9JKP7 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pole3Q9JKP7 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pole3Q9JKP7 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pole3Q9JKP7 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pole3Q9JKP7 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pole3Q9JKP7 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pole3Q9JKP7 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pole3Q9JKP7 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pole3Q9JKP7 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pole3Q9JKP7 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pole3Q9JKP7 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pole3Q9JKP7 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pole3Q9JKP7 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pole3Q9JKP7 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pole3Q9JKP7 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pole3Q9JKP7 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pole3Q9JKP7 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pole3Q9JKP7 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pole3Q9JKP7 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pole3Q9JKP7 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pole3Q9JKP7 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pole3Q9JKP7 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pole3Q9JKP7 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pole3Q9JKP7 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pole3Q9JKP7 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pole3Q9JKP7 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pole3Q9JKP7 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pole3Q9JKP7 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pole3Q9JKP7 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pole3Q9JKP7 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pole3Q9JKP7 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pole3Q9JKP7 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms