Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rb1cc1Q9ESK9 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rb1cc1Q9ESK9 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Rb1cc1Q9ESK9 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rb1cc1Q9ESK9 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rb1cc1Q9ESK9 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rb1cc1Q9ESK9 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rb1cc1Q9ESK9 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rb1cc1Q9ESK9 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rb1cc1Q9ESK9 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rb1cc1Q9ESK9 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rb1cc1Q9ESK9 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rb1cc1Q9ESK9 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rb1cc1Q9ESK9 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rb1cc1Q9ESK9 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rb1cc1Q9ESK9 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rb1cc1Q9ESK9 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rb1cc1Q9ESK9 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rb1cc1Q9ESK9 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rb1cc1Q9ESK9 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.56
Rb1cc1Q9ESK9 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rb1cc1Q9ESK9 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rb1cc1Q9ESK9 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rb1cc1Q9ESK9 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rb1cc1Q9ESK9 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rb1cc1Q9ESK9 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rb1cc1Q9ESK9 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rb1cc1Q9ESK9 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rb1cc1Q9ESK9 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rb1cc1Q9ESK9 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rb1cc1Q9ESK9 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rb1cc1Q9ESK9 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rb1cc1Q9ESK9 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Rb1cc1Q9ESK9 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rb1cc1Q9ESK9 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rb1cc1Q9ESK9 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rb1cc1Q9ESK9 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rb1cc1Q9ESK9 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rb1cc1Q9ESK9 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
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Rb1cc1Q9ESK9 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rb1cc1Q9ESK9 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rb1cc1Q9ESK9 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
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Rb1cc1Q9ESK9 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rb1cc1Q9ESK9 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rb1cc1Q9ESK9 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
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Rb1cc1Q9ESK9 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
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Rb1cc1Q9ESK9 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
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Rb1cc1Q9ESK9 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rb1cc1Q9ESK9 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rb1cc1Q9ESK9 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rb1cc1Q9ESK9 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
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Rb1cc1Q9ESK9 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rb1cc1Q9ESK9 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
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Rb1cc1Q9ESK9 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Rb1cc1Q9ESK9 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
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Rb1cc1Q9ESK9 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
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Rb1cc1Q9ESK9 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rb1cc1Q9ESK9 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rb1cc1Q9ESK9 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
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Rb1cc1Q9ESK9 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
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