Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES64

Ush1c, Harmonin, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ush1cQ9ES64 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms