Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERP3

Trim54, Tripartite motif-containing protein 54, mousemouse

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim54Q9ERP3 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim54Q9ERP3 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim54Q9ERP3 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Trim54Q9ERP3 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Trim54Q9ERP3 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim54Q9ERP3 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim54Q9ERP3 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim54Q9ERP3 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim54Q9ERP3 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim54Q9ERP3 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim54Q9ERP3 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim54Q9ERP3 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Trim54Q9ERP3 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Trim54Q9ERP3 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trim54Q9ERP3 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Trim54Q9ERP3 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Trim54Q9ERP3 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Trim54Q9ERP3 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim54Q9ERP3 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim54Q9ERP3 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim54Q9ERP3 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trim54Q9ERP3 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim54Q9ERP3 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim54Q9ERP3 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim54Q9ERP3 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim54Q9ERP3 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim54Q9ERP3 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim54Q9ERP3 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Trim54Q9ERP3 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim54Q9ERP3 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Trim54Q9ERP3 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim54Q9ERP3 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim54Q9ERP3 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim54Q9ERP3 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim54Q9ERP3 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trim54Q9ERP3 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim54Q9ERP3 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim54Q9ERP3 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Trim54Q9ERP3 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim54Q9ERP3 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim54Q9ERP3 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim54Q9ERP3 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Trim54Q9ERP3 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Trim54Q9ERP3 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Trim54Q9ERP3 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim54Q9ERP3 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trim54Q9ERP3 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim54Q9ERP3 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Trim54Q9ERP3 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim54Q9ERP3 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim54Q9ERP3 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim54Q9ERP3 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim54Q9ERP3 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim54Q9ERP3 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Trim54Q9ERP3 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Trim54Q9ERP3 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim54Q9ERP3 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim54Q9ERP3 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Trim54Q9ERP3 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trim54Q9ERP3 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim54Q9ERP3 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trim54Q9ERP3 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim54Q9ERP3 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim54Q9ERP3 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim54Q9ERP3 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim54Q9ERP3 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim54Q9ERP3 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim54Q9ERP3 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim54Q9ERP3 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Trim54Q9ERP3 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trim54Q9ERP3 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trim54Q9ERP3 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Trim54Q9ERP3 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trim54Q9ERP3 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trim54Q9ERP3 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trim54Q9ERP3 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trim54Q9ERP3 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Trim54Q9ERP3 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trim54Q9ERP3 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trim54Q9ERP3 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trim54Q9ERP3 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Trim54Q9ERP3 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trim54Q9ERP3 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trim54Q9ERP3 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trim54Q9ERP3 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Trim54Q9ERP3 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Trim54Q9ERP3 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Trim54Q9ERP3 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Trim54Q9ERP3 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Trim54Q9ERP3 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trim54Q9ERP3 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Trim54Q9ERP3 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Trim54Q9ERP3 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Trim54Q9ERP3 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Trim54Q9ERP3 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trim54Q9ERP3 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trim54Q9ERP3 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trim54Q9ERP3 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trim54Q9ERP3 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trim54Q9ERP3 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
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