Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SgshQ9EQ08 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SgshQ9EQ08 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SgshQ9EQ08 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SgshQ9EQ08 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SgshQ9EQ08 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SgshQ9EQ08 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
SgshQ9EQ08 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SgshQ9EQ08 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SgshQ9EQ08 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SgshQ9EQ08 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SgshQ9EQ08 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SgshQ9EQ08 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SgshQ9EQ08 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SgshQ9EQ08 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SgshQ9EQ08 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SgshQ9EQ08 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
SgshQ9EQ08 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SgshQ9EQ08 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SgshQ9EQ08 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SgshQ9EQ08 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SgshQ9EQ08 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SgshQ9EQ08 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SgshQ9EQ08 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SgshQ9EQ08 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SgshQ9EQ08 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SgshQ9EQ08 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
SgshQ9EQ08 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SgshQ9EQ08 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SgshQ9EQ08 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
SgshQ9EQ08 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SgshQ9EQ08 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
SgshQ9EQ08 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SgshQ9EQ08 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
SgshQ9EQ08 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SgshQ9EQ08 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SgshQ9EQ08 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SgshQ9EQ08 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SgshQ9EQ08 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SgshQ9EQ08 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SgshQ9EQ08 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SgshQ9EQ08 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SgshQ9EQ08 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SgshQ9EQ08 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SgshQ9EQ08 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SgshQ9EQ08 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SgshQ9EQ08 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
SgshQ9EQ08 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SgshQ9EQ08 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
SgshQ9EQ08 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SgshQ9EQ08 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SgshQ9EQ08 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SgshQ9EQ08 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms