Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCG9

Trmt112, Multifunctional methyltransferase subunit TRM112-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt112Q9DCG9 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trmt112Q9DCG9 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trmt112Q9DCG9 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trmt112Q9DCG9 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trmt112Q9DCG9 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trmt112Q9DCG9 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trmt112Q9DCG9 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trmt112Q9DCG9 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trmt112Q9DCG9 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trmt112Q9DCG9 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trmt112Q9DCG9 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trmt112Q9DCG9 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trmt112Q9DCG9 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trmt112Q9DCG9 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trmt112Q9DCG9 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trmt112Q9DCG9 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trmt112Q9DCG9 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trmt112Q9DCG9 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trmt112Q9DCG9 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trmt112Q9DCG9 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trmt112Q9DCG9 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trmt112Q9DCG9 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trmt112Q9DCG9 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trmt112Q9DCG9 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trmt112Q9DCG9 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Trmt112Q9DCG9 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Trmt112Q9DCG9 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trmt112Q9DCG9 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trmt112Q9DCG9 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trmt112Q9DCG9 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trmt112Q9DCG9 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trmt112Q9DCG9 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Trmt112Q9DCG9 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Trmt112Q9DCG9 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Trmt112Q9DCG9 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trmt112Q9DCG9 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trmt112Q9DCG9 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trmt112Q9DCG9 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trmt112Q9DCG9 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trmt112Q9DCG9 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Trmt112Q9DCG9 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trmt112Q9DCG9 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trmt112Q9DCG9 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trmt112Q9DCG9 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trmt112Q9DCG9 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trmt112Q9DCG9 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trmt112Q9DCG9 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trmt112Q9DCG9 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trmt112Q9DCG9 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trmt112Q9DCG9 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trmt112Q9DCG9 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trmt112Q9DCG9 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trmt112Q9DCG9 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trmt112Q9DCG9 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trmt112Q9DCG9 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trmt112Q9DCG9 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trmt112Q9DCG9 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Trmt112Q9DCG9 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trmt112Q9DCG9 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trmt112Q9DCG9 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Trmt112Q9DCG9 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trmt112Q9DCG9 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trmt112Q9DCG9 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trmt112Q9DCG9 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trmt112Q9DCG9 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trmt112Q9DCG9 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trmt112Q9DCG9 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trmt112Q9DCG9 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trmt112Q9DCG9 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trmt112Q9DCG9 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trmt112Q9DCG9 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trmt112Q9DCG9 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trmt112Q9DCG9 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trmt112Q9DCG9 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trmt112Q9DCG9 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trmt112Q9DCG9 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trmt112Q9DCG9 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trmt112Q9DCG9 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trmt112Q9DCG9 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trmt112Q9DCG9 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trmt112Q9DCG9 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trmt112Q9DCG9 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trmt112Q9DCG9 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trmt112Q9DCG9 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trmt112Q9DCG9 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trmt112Q9DCG9 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trmt112Q9DCG9 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trmt112Q9DCG9 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trmt112Q9DCG9 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trmt112Q9DCG9 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trmt112Q9DCG9 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trmt112Q9DCG9 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trmt112Q9DCG9 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trmt112Q9DCG9 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trmt112Q9DCG9 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trmt112Q9DCG9 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trmt112Q9DCG9 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trmt112Q9DCG9 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trmt112Q9DCG9 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trmt112Q9DCG9 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms