Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB40

Med27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med27Q9DB40 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Med27Q9DB40 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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