Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9N2

Cldn34b2, Claudin 34B2, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b2Q9D9N2 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.2 ms