Protein–RNA interactions for Protein: Q9D783

Klhl40, Kelch-like protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl40Q9D783 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klhl40Q9D783 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klhl40Q9D783 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klhl40Q9D783 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klhl40Q9D783 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klhl40Q9D783 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klhl40Q9D783 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klhl40Q9D783 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klhl40Q9D783 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klhl40Q9D783 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klhl40Q9D783 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klhl40Q9D783 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klhl40Q9D783 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klhl40Q9D783 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klhl40Q9D783 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klhl40Q9D783 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klhl40Q9D783 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klhl40Q9D783 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klhl40Q9D783 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klhl40Q9D783 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klhl40Q9D783 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klhl40Q9D783 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klhl40Q9D783 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klhl40Q9D783 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klhl40Q9D783 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klhl40Q9D783 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klhl40Q9D783 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klhl40Q9D783 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klhl40Q9D783 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klhl40Q9D783 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klhl40Q9D783 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Klhl40Q9D783 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Klhl40Q9D783 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Klhl40Q9D783 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klhl40Q9D783 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klhl40Q9D783 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Klhl40Q9D783 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klhl40Q9D783 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Klhl40Q9D783 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klhl40Q9D783 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klhl40Q9D783 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klhl40Q9D783 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klhl40Q9D783 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klhl40Q9D783 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klhl40Q9D783 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klhl40Q9D783 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klhl40Q9D783 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klhl40Q9D783 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klhl40Q9D783 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klhl40Q9D783 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klhl40Q9D783 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klhl40Q9D783 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klhl40Q9D783 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klhl40Q9D783 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klhl40Q9D783 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klhl40Q9D783 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klhl40Q9D783 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klhl40Q9D783 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klhl40Q9D783 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klhl40Q9D783 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klhl40Q9D783 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klhl40Q9D783 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klhl40Q9D783 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klhl40Q9D783 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klhl40Q9D783 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klhl40Q9D783 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klhl40Q9D783 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klhl40Q9D783 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klhl40Q9D783 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klhl40Q9D783 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klhl40Q9D783 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klhl40Q9D783 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klhl40Q9D783 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klhl40Q9D783 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klhl40Q9D783 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Klhl40Q9D783 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Klhl40Q9D783 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klhl40Q9D783 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klhl40Q9D783 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klhl40Q9D783 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klhl40Q9D783 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klhl40Q9D783 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klhl40Q9D783 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klhl40Q9D783 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klhl40Q9D783 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klhl40Q9D783 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klhl40Q9D783 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klhl40Q9D783 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klhl40Q9D783 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klhl40Q9D783 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klhl40Q9D783 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klhl40Q9D783 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klhl40Q9D783 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klhl40Q9D783 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klhl40Q9D783 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klhl40Q9D783 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klhl40Q9D783 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klhl40Q9D783 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klhl40Q9D783 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klhl40Q9D783 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms