Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H2

Gcc1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcc1Q9D4H2 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gcc1Q9D4H2 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Gcc1Q9D4H2 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gcc1Q9D4H2 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gcc1Q9D4H2 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gcc1Q9D4H2 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Gcc1Q9D4H2 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Gcc1Q9D4H2 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Gcc1Q9D4H2 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gcc1Q9D4H2 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Gcc1Q9D4H2 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gcc1Q9D4H2 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gcc1Q9D4H2 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gcc1Q9D4H2 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gcc1Q9D4H2 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gcc1Q9D4H2 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gcc1Q9D4H2 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gcc1Q9D4H2 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gcc1Q9D4H2 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gcc1Q9D4H2 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gcc1Q9D4H2 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gcc1Q9D4H2 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gcc1Q9D4H2 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gcc1Q9D4H2 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gcc1Q9D4H2 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gcc1Q9D4H2 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gcc1Q9D4H2 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gcc1Q9D4H2 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gcc1Q9D4H2 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gcc1Q9D4H2 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gcc1Q9D4H2 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gcc1Q9D4H2 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gcc1Q9D4H2 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gcc1Q9D4H2 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gcc1Q9D4H2 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gcc1Q9D4H2 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gcc1Q9D4H2 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gcc1Q9D4H2 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Gcc1Q9D4H2 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gcc1Q9D4H2 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gcc1Q9D4H2 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gcc1Q9D4H2 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gcc1Q9D4H2 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gcc1Q9D4H2 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gcc1Q9D4H2 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gcc1Q9D4H2 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Gcc1Q9D4H2 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gcc1Q9D4H2 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gcc1Q9D4H2 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Gcc1Q9D4H2 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gcc1Q9D4H2 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gcc1Q9D4H2 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gcc1Q9D4H2 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gcc1Q9D4H2 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gcc1Q9D4H2 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gcc1Q9D4H2 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gcc1Q9D4H2 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gcc1Q9D4H2 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gcc1Q9D4H2 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gcc1Q9D4H2 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gcc1Q9D4H2 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gcc1Q9D4H2 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gcc1Q9D4H2 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gcc1Q9D4H2 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gcc1Q9D4H2 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gcc1Q9D4H2 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Gcc1Q9D4H2 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gcc1Q9D4H2 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gcc1Q9D4H2 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gcc1Q9D4H2 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gcc1Q9D4H2 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gcc1Q9D4H2 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gcc1Q9D4H2 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gcc1Q9D4H2 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gcc1Q9D4H2 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gcc1Q9D4H2 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gcc1Q9D4H2 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gcc1Q9D4H2 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gcc1Q9D4H2 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gcc1Q9D4H2 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gcc1Q9D4H2 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gcc1Q9D4H2 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gcc1Q9D4H2 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gcc1Q9D4H2 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gcc1Q9D4H2 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gcc1Q9D4H2 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gcc1Q9D4H2 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gcc1Q9D4H2 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gcc1Q9D4H2 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gcc1Q9D4H2 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gcc1Q9D4H2 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gcc1Q9D4H2 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gcc1Q9D4H2 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gcc1Q9D4H2 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gcc1Q9D4H2 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gcc1Q9D4H2 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gcc1Q9D4H2 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Gcc1Q9D4H2 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Gcc1Q9D4H2 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Gcc1Q9D4H2 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms