Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syce1Q9D495 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syce1Q9D495 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syce1Q9D495 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Syce1Q9D495 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syce1Q9D495 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syce1Q9D495 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syce1Q9D495 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syce1Q9D495 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syce1Q9D495 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syce1Q9D495 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syce1Q9D495 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syce1Q9D495 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syce1Q9D495 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syce1Q9D495 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syce1Q9D495 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syce1Q9D495 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syce1Q9D495 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syce1Q9D495 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syce1Q9D495 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Syce1Q9D495 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syce1Q9D495 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syce1Q9D495 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syce1Q9D495 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syce1Q9D495 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syce1Q9D495 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syce1Q9D495 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syce1Q9D495 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syce1Q9D495 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syce1Q9D495 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syce1Q9D495 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syce1Q9D495 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syce1Q9D495 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syce1Q9D495 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syce1Q9D495 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syce1Q9D495 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syce1Q9D495 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syce1Q9D495 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syce1Q9D495 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syce1Q9D495 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syce1Q9D495 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syce1Q9D495 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syce1Q9D495 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syce1Q9D495 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syce1Q9D495 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syce1Q9D495 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syce1Q9D495 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syce1Q9D495 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Syce1Q9D495 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syce1Q9D495 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syce1Q9D495 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Syce1Q9D495 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syce1Q9D495 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syce1Q9D495 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syce1Q9D495 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syce1Q9D495 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Syce1Q9D495 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syce1Q9D495 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Syce1Q9D495 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syce1Q9D495 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syce1Q9D495 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syce1Q9D495 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syce1Q9D495 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syce1Q9D495 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syce1Q9D495 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syce1Q9D495 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syce1Q9D495 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syce1Q9D495 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syce1Q9D495 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syce1Q9D495 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syce1Q9D495 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syce1Q9D495 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syce1Q9D495 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syce1Q9D495 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syce1Q9D495 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Syce1Q9D495 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Syce1Q9D495 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syce1Q9D495 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syce1Q9D495 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syce1Q9D495 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syce1Q9D495 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syce1Q9D495 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syce1Q9D495 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syce1Q9D495 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syce1Q9D495 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syce1Q9D495 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syce1Q9D495 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syce1Q9D495 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syce1Q9D495 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syce1Q9D495 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syce1Q9D495 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syce1Q9D495 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syce1Q9D495 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syce1Q9D495 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syce1Q9D495 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syce1Q9D495 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Syce1Q9D495 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syce1Q9D495 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syce1Q9D495 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syce1Q9D495 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms