Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms