Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWN7

Cnot11, CCR4-NOT transcription complex subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot11Q9CWN7 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms