Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms