Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN4

Rhobtb3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb3Q9CTN4 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rhobtb3Q9CTN4 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rhobtb3Q9CTN4 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhobtb3Q9CTN4 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhobtb3Q9CTN4 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms