Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSB4

Pard3b, Partitioning defective 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 1,203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard3bQ9CSB4 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.1 ms