Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW9

Ifitm3, Interferon-induced transmembrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifitm3Q9CQW9 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ifitm3Q9CQW9 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ifitm3Q9CQW9 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ifitm3Q9CQW9 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ifitm3Q9CQW9 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Ifitm3Q9CQW9 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Ifitm3Q9CQW9 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Ifitm3Q9CQW9 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Ifitm3Q9CQW9 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ifitm3Q9CQW9 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ifitm3Q9CQW9 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ifitm3Q9CQW9 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ifitm3Q9CQW9 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ifitm3Q9CQW9 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ifitm3Q9CQW9 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ifitm3Q9CQW9 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ifitm3Q9CQW9 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ifitm3Q9CQW9 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ifitm3Q9CQW9 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ifitm3Q9CQW9 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ifitm3Q9CQW9 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Ifitm3Q9CQW9 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ifitm3Q9CQW9 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ifitm3Q9CQW9 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ifitm3Q9CQW9 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ifitm3Q9CQW9 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ifitm3Q9CQW9 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ifitm3Q9CQW9 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ifitm3Q9CQW9 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ifitm3Q9CQW9 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ifitm3Q9CQW9 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ifitm3Q9CQW9 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ifitm3Q9CQW9 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ifitm3Q9CQW9 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ifitm3Q9CQW9 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ifitm3Q9CQW9 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ifitm3Q9CQW9 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ifitm3Q9CQW9 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ifitm3Q9CQW9 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ifitm3Q9CQW9 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ifitm3Q9CQW9 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ifitm3Q9CQW9 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ifitm3Q9CQW9 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ifitm3Q9CQW9 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ifitm3Q9CQW9 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ifitm3Q9CQW9 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ifitm3Q9CQW9 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ifitm3Q9CQW9 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ifitm3Q9CQW9 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ifitm3Q9CQW9 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ifitm3Q9CQW9 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ifitm3Q9CQW9 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ifitm3Q9CQW9 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ifitm3Q9CQW9 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ifitm3Q9CQW9 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ifitm3Q9CQW9 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ifitm3Q9CQW9 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ifitm3Q9CQW9 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ifitm3Q9CQW9 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Ifitm3Q9CQW9 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ifitm3Q9CQW9 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ifitm3Q9CQW9 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ifitm3Q9CQW9 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ifitm3Q9CQW9 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Ifitm3Q9CQW9 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ifitm3Q9CQW9 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ifitm3Q9CQW9 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ifitm3Q9CQW9 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ifitm3Q9CQW9 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ifitm3Q9CQW9 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ifitm3Q9CQW9 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ifitm3Q9CQW9 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ifitm3Q9CQW9 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ifitm3Q9CQW9 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ifitm3Q9CQW9 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ifitm3Q9CQW9 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ifitm3Q9CQW9 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ifitm3Q9CQW9 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ifitm3Q9CQW9 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Ifitm3Q9CQW9 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ifitm3Q9CQW9 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ifitm3Q9CQW9 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ifitm3Q9CQW9 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ifitm3Q9CQW9 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ifitm3Q9CQW9 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ifitm3Q9CQW9 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ifitm3Q9CQW9 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ifitm3Q9CQW9 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ifitm3Q9CQW9 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ifitm3Q9CQW9 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Ifitm3Q9CQW9 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ifitm3Q9CQW9 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Ifitm3Q9CQW9 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ifitm3Q9CQW9 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ifitm3Q9CQW9 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ifitm3Q9CQW9 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ifitm3Q9CQW9 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ifitm3Q9CQW9 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ifitm3Q9CQW9 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ifitm3Q9CQW9 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms