Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW1

Ykt6, Synaptobrevin homolog YKT6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ykt6Q9CQW1 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms