Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL6

Mrpl35, 39S ribosomal protein L35, mitochondrial, mousemouse

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl35Q9CQL6 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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Mrpl35Q9CQL6 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms