Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ8

Ndufb9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb9Q9CQJ8 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.1 ms