Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms