Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ18

Rnaseh2c, Ribonuclease H2 subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnaseh2cQ9CQ18 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms