Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPV3

Mrpl42, 39S ribosomal protein L42, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl42Q9CPV3 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl42Q9CPV3 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl42Q9CPV3 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl42Q9CPV3 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl42Q9CPV3 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl42Q9CPV3 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl42Q9CPV3 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl42Q9CPV3 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl42Q9CPV3 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl42Q9CPV3 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl42Q9CPV3 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl42Q9CPV3 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl42Q9CPV3 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl42Q9CPV3 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl42Q9CPV3 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl42Q9CPV3 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl42Q9CPV3 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl42Q9CPV3 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl42Q9CPV3 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl42Q9CPV3 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl42Q9CPV3 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl42Q9CPV3 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl42Q9CPV3 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl42Q9CPV3 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl42Q9CPV3 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl42Q9CPV3 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl42Q9CPV3 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl42Q9CPV3 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl42Q9CPV3 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl42Q9CPV3 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl42Q9CPV3 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl42Q9CPV3 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl42Q9CPV3 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl42Q9CPV3 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl42Q9CPV3 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl42Q9CPV3 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl42Q9CPV3 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl42Q9CPV3 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl42Q9CPV3 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl42Q9CPV3 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl42Q9CPV3 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl42Q9CPV3 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl42Q9CPV3 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl42Q9CPV3 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl42Q9CPV3 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl42Q9CPV3 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl42Q9CPV3 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl42Q9CPV3 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl42Q9CPV3 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl42Q9CPV3 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl42Q9CPV3 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl42Q9CPV3 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl42Q9CPV3 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl42Q9CPV3 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl42Q9CPV3 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl42Q9CPV3 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl42Q9CPV3 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl42Q9CPV3 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl42Q9CPV3 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl42Q9CPV3 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl42Q9CPV3 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl42Q9CPV3 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl42Q9CPV3 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl42Q9CPV3 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl42Q9CPV3 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl42Q9CPV3 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl42Q9CPV3 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl42Q9CPV3 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl42Q9CPV3 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl42Q9CPV3 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl42Q9CPV3 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl42Q9CPV3 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl42Q9CPV3 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl42Q9CPV3 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl42Q9CPV3 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl42Q9CPV3 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl42Q9CPV3 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl42Q9CPV3 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl42Q9CPV3 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl42Q9CPV3 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl42Q9CPV3 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl42Q9CPV3 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl42Q9CPV3 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl42Q9CPV3 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl42Q9CPV3 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl42Q9CPV3 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl42Q9CPV3 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl42Q9CPV3 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl42Q9CPV3 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl42Q9CPV3 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl42Q9CPV3 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl42Q9CPV3 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl42Q9CPV3 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl42Q9CPV3 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl42Q9CPV3 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl42Q9CPV3 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl42Q9CPV3 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl42Q9CPV3 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl42Q9CPV3 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl42Q9CPV3 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms