Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB8

Ubqln4, Ubiquilin-4, mousemouse

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Length 596 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ubqln4Q99NB8 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ubqln4Q99NB8 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Ubqln4Q99NB8 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Ubqln4Q99NB8 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Ubqln4Q99NB8 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ubqln4Q99NB8 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ubqln4Q99NB8 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ubqln4Q99NB8 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ubqln4Q99NB8 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ubqln4Q99NB8 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ubqln4Q99NB8 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ubqln4Q99NB8 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Ubqln4Q99NB8 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ubqln4Q99NB8 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ubqln4Q99NB8 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ubqln4Q99NB8 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ubqln4Q99NB8 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ubqln4Q99NB8 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ubqln4Q99NB8 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Ubqln4Q99NB8 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms