Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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