Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

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Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Ctu1Q99J10 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Ctu1Q99J10 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Ctu1Q99J10 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Ctu1Q99J10 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms