Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms