Protein–RNA interactions for Protein: Q920A7

Afg3l1, AFG3-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l1Q920A7 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Afg3l1Q920A7 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Afg3l1Q920A7 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Afg3l1Q920A7 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Afg3l1Q920A7 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Afg3l1Q920A7 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Afg3l1Q920A7 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Afg3l1Q920A7 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Afg3l1Q920A7 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Afg3l1Q920A7 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Afg3l1Q920A7 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Afg3l1Q920A7 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Afg3l1Q920A7 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Afg3l1Q920A7 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Afg3l1Q920A7 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Afg3l1Q920A7 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Afg3l1Q920A7 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Afg3l1Q920A7 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Afg3l1Q920A7 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Afg3l1Q920A7 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Afg3l1Q920A7 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Afg3l1Q920A7 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Afg3l1Q920A7 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Afg3l1Q920A7 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Afg3l1Q920A7 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Afg3l1Q920A7 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Afg3l1Q920A7 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Afg3l1Q920A7 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Afg3l1Q920A7 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Afg3l1Q920A7 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Afg3l1Q920A7 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Afg3l1Q920A7 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Afg3l1Q920A7 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Afg3l1Q920A7 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Afg3l1Q920A7 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Afg3l1Q920A7 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Afg3l1Q920A7 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Afg3l1Q920A7 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Afg3l1Q920A7 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Afg3l1Q920A7 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Afg3l1Q920A7 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Afg3l1Q920A7 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Afg3l1Q920A7 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Afg3l1Q920A7 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Afg3l1Q920A7 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Afg3l1Q920A7 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Afg3l1Q920A7 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Afg3l1Q920A7 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Afg3l1Q920A7 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Afg3l1Q920A7 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Afg3l1Q920A7 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Afg3l1Q920A7 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Afg3l1Q920A7 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Afg3l1Q920A7 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Afg3l1Q920A7 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Afg3l1Q920A7 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Afg3l1Q920A7 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Afg3l1Q920A7 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Afg3l1Q920A7 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Afg3l1Q920A7 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Afg3l1Q920A7 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Afg3l1Q920A7 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Afg3l1Q920A7 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Afg3l1Q920A7 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Afg3l1Q920A7 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Afg3l1Q920A7 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Afg3l1Q920A7 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Afg3l1Q920A7 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Afg3l1Q920A7 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Afg3l1Q920A7 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Afg3l1Q920A7 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Afg3l1Q920A7 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Afg3l1Q920A7 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Afg3l1Q920A7 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Afg3l1Q920A7 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Afg3l1Q920A7 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Afg3l1Q920A7 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Afg3l1Q920A7 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Afg3l1Q920A7 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Afg3l1Q920A7 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Afg3l1Q920A7 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Afg3l1Q920A7 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Afg3l1Q920A7 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Afg3l1Q920A7 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Afg3l1Q920A7 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Afg3l1Q920A7 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Afg3l1Q920A7 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Afg3l1Q920A7 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Afg3l1Q920A7 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Afg3l1Q920A7 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Afg3l1Q920A7 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Afg3l1Q920A7 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Afg3l1Q920A7 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Afg3l1Q920A7 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Afg3l1Q920A7 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Afg3l1Q920A7 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Afg3l1Q920A7 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Afg3l1Q920A7 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Afg3l1Q920A7 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Afg3l1Q920A7 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms