Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZU9

Grin3b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin3bQ91ZU9 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grin3bQ91ZU9 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grin3bQ91ZU9 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Grin3bQ91ZU9 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Grin3bQ91ZU9 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Grin3bQ91ZU9 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Grin3bQ91ZU9 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Grin3bQ91ZU9 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Grin3bQ91ZU9 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Grin3bQ91ZU9 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Grin3bQ91ZU9 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Grin3bQ91ZU9 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Grin3bQ91ZU9 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Grin3bQ91ZU9 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Grin3bQ91ZU9 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Grin3bQ91ZU9 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Grin3bQ91ZU9 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Grin3bQ91ZU9 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Grin3bQ91ZU9 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Grin3bQ91ZU9 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Grin3bQ91ZU9 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Grin3bQ91ZU9 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Grin3bQ91ZU9 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Grin3bQ91ZU9 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Grin3bQ91ZU9 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Grin3bQ91ZU9 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Grin3bQ91ZU9 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Grin3bQ91ZU9 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Grin3bQ91ZU9 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Grin3bQ91ZU9 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Grin3bQ91ZU9 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Grin3bQ91ZU9 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Grin3bQ91ZU9 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Grin3bQ91ZU9 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Grin3bQ91ZU9 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Grin3bQ91ZU9 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grin3bQ91ZU9 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grin3bQ91ZU9 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grin3bQ91ZU9 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grin3bQ91ZU9 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grin3bQ91ZU9 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grin3bQ91ZU9 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grin3bQ91ZU9 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grin3bQ91ZU9 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grin3bQ91ZU9 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grin3bQ91ZU9 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grin3bQ91ZU9 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grin3bQ91ZU9 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grin3bQ91ZU9 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grin3bQ91ZU9 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grin3bQ91ZU9 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grin3bQ91ZU9 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grin3bQ91ZU9 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Grin3bQ91ZU9 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grin3bQ91ZU9 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grin3bQ91ZU9 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grin3bQ91ZU9 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grin3bQ91ZU9 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Grin3bQ91ZU9 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grin3bQ91ZU9 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Grin3bQ91ZU9 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grin3bQ91ZU9 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grin3bQ91ZU9 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grin3bQ91ZU9 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grin3bQ91ZU9 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grin3bQ91ZU9 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grin3bQ91ZU9 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grin3bQ91ZU9 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grin3bQ91ZU9 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grin3bQ91ZU9 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grin3bQ91ZU9 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Grin3bQ91ZU9 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grin3bQ91ZU9 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grin3bQ91ZU9 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grin3bQ91ZU9 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grin3bQ91ZU9 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grin3bQ91ZU9 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grin3bQ91ZU9 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grin3bQ91ZU9 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grin3bQ91ZU9 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grin3bQ91ZU9 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grin3bQ91ZU9 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grin3bQ91ZU9 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grin3bQ91ZU9 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Grin3bQ91ZU9 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grin3bQ91ZU9 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grin3bQ91ZU9 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Grin3bQ91ZU9 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grin3bQ91ZU9 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grin3bQ91ZU9 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grin3bQ91ZU9 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grin3bQ91ZU9 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grin3bQ91ZU9 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grin3bQ91ZU9 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grin3bQ91ZU9 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grin3bQ91ZU9 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grin3bQ91ZU9 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grin3bQ91ZU9 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grin3bQ91ZU9 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grin3bQ91ZU9 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms