Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC5

Cabp4, Calcium-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp4Q8VHC5 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cabp4Q8VHC5 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cabp4Q8VHC5 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cabp4Q8VHC5 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cabp4Q8VHC5 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cabp4Q8VHC5 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cabp4Q8VHC5 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cabp4Q8VHC5 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Cabp4Q8VHC5 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cabp4Q8VHC5 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cabp4Q8VHC5 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cabp4Q8VHC5 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cabp4Q8VHC5 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cabp4Q8VHC5 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cabp4Q8VHC5 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cabp4Q8VHC5 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cabp4Q8VHC5 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cabp4Q8VHC5 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Cabp4Q8VHC5 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cabp4Q8VHC5 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cabp4Q8VHC5 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cabp4Q8VHC5 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cabp4Q8VHC5 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cabp4Q8VHC5 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cabp4Q8VHC5 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Cabp4Q8VHC5 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cabp4Q8VHC5 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cabp4Q8VHC5 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cabp4Q8VHC5 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cabp4Q8VHC5 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cabp4Q8VHC5 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cabp4Q8VHC5 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cabp4Q8VHC5 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cabp4Q8VHC5 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cabp4Q8VHC5 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cabp4Q8VHC5 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cabp4Q8VHC5 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cabp4Q8VHC5 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cabp4Q8VHC5 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cabp4Q8VHC5 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Cabp4Q8VHC5 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cabp4Q8VHC5 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cabp4Q8VHC5 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Cabp4Q8VHC5 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cabp4Q8VHC5 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cabp4Q8VHC5 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cabp4Q8VHC5 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cabp4Q8VHC5 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cabp4Q8VHC5 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cabp4Q8VHC5 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cabp4Q8VHC5 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cabp4Q8VHC5 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cabp4Q8VHC5 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cabp4Q8VHC5 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cabp4Q8VHC5 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cabp4Q8VHC5 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cabp4Q8VHC5 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cabp4Q8VHC5 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cabp4Q8VHC5 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms