Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBV7

Cops8, COP9 signalosome complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops8Q8VBV7 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cops8Q8VBV7 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Cops8Q8VBV7 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cops8Q8VBV7 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Cops8Q8VBV7 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cops8Q8VBV7 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cops8Q8VBV7 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cops8Q8VBV7 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cops8Q8VBV7 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cops8Q8VBV7 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cops8Q8VBV7 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cops8Q8VBV7 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cops8Q8VBV7 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cops8Q8VBV7 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cops8Q8VBV7 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cops8Q8VBV7 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cops8Q8VBV7 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cops8Q8VBV7 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cops8Q8VBV7 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cops8Q8VBV7 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cops8Q8VBV7 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cops8Q8VBV7 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cops8Q8VBV7 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cops8Q8VBV7 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cops8Q8VBV7 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cops8Q8VBV7 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cops8Q8VBV7 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cops8Q8VBV7 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cops8Q8VBV7 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cops8Q8VBV7 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cops8Q8VBV7 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cops8Q8VBV7 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cops8Q8VBV7 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cops8Q8VBV7 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cops8Q8VBV7 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cops8Q8VBV7 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cops8Q8VBV7 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cops8Q8VBV7 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cops8Q8VBV7 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cops8Q8VBV7 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cops8Q8VBV7 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cops8Q8VBV7 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cops8Q8VBV7 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cops8Q8VBV7 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cops8Q8VBV7 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cops8Q8VBV7 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cops8Q8VBV7 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cops8Q8VBV7 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cops8Q8VBV7 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cops8Q8VBV7 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cops8Q8VBV7 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cops8Q8VBV7 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cops8Q8VBV7 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cops8Q8VBV7 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cops8Q8VBV7 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cops8Q8VBV7 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cops8Q8VBV7 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cops8Q8VBV7 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cops8Q8VBV7 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cops8Q8VBV7 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cops8Q8VBV7 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cops8Q8VBV7 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cops8Q8VBV7 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cops8Q8VBV7 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cops8Q8VBV7 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cops8Q8VBV7 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cops8Q8VBV7 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cops8Q8VBV7 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cops8Q8VBV7 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cops8Q8VBV7 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cops8Q8VBV7 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cops8Q8VBV7 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cops8Q8VBV7 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cops8Q8VBV7 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cops8Q8VBV7 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cops8Q8VBV7 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cops8Q8VBV7 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cops8Q8VBV7 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cops8Q8VBV7 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cops8Q8VBV7 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cops8Q8VBV7 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cops8Q8VBV7 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cops8Q8VBV7 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cops8Q8VBV7 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cops8Q8VBV7 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cops8Q8VBV7 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Cops8Q8VBV7 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cops8Q8VBV7 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cops8Q8VBV7 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cops8Q8VBV7 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cops8Q8VBV7 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cops8Q8VBV7 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cops8Q8VBV7 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cops8Q8VBV7 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cops8Q8VBV7 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cops8Q8VBV7 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cops8Q8VBV7 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cops8Q8VBV7 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cops8Q8VBV7 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cops8Q8VBV7 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms