Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3W3

Casc3, Protein CASC3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 698 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc3Q8K3W3 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Casc3Q8K3W3 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Casc3Q8K3W3 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Casc3Q8K3W3 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Casc3Q8K3W3 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Casc3Q8K3W3 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Casc3Q8K3W3 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Casc3Q8K3W3 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Casc3Q8K3W3 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Casc3Q8K3W3 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Casc3Q8K3W3 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Casc3Q8K3W3 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Casc3Q8K3W3 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Casc3Q8K3W3 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Casc3Q8K3W3 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Casc3Q8K3W3 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Casc3Q8K3W3 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Casc3Q8K3W3 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Casc3Q8K3W3 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Casc3Q8K3W3 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Casc3Q8K3W3 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Casc3Q8K3W3 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Casc3Q8K3W3 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Casc3Q8K3W3 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Casc3Q8K3W3 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Casc3Q8K3W3 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Casc3Q8K3W3 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Casc3Q8K3W3 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Casc3Q8K3W3 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Casc3Q8K3W3 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Casc3Q8K3W3 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Casc3Q8K3W3 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Casc3Q8K3W3 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Casc3Q8K3W3 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Casc3Q8K3W3 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Casc3Q8K3W3 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Casc3Q8K3W3 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Casc3Q8K3W3 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Casc3Q8K3W3 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Casc3Q8K3W3 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Casc3Q8K3W3 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Casc3Q8K3W3 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Casc3Q8K3W3 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Casc3Q8K3W3 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Casc3Q8K3W3 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Casc3Q8K3W3 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Casc3Q8K3W3 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Casc3Q8K3W3 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Casc3Q8K3W3 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Casc3Q8K3W3 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Casc3Q8K3W3 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Casc3Q8K3W3 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Casc3Q8K3W3 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Casc3Q8K3W3 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Casc3Q8K3W3 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Casc3Q8K3W3 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Casc3Q8K3W3 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Casc3Q8K3W3 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Casc3Q8K3W3 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Casc3Q8K3W3 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Casc3Q8K3W3 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Casc3Q8K3W3 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Casc3Q8K3W3 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Casc3Q8K3W3 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Casc3Q8K3W3 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Casc3Q8K3W3 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Casc3Q8K3W3 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Casc3Q8K3W3 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Casc3Q8K3W3 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Casc3Q8K3W3 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Casc3Q8K3W3 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Casc3Q8K3W3 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Casc3Q8K3W3 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Casc3Q8K3W3 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Casc3Q8K3W3 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Casc3Q8K3W3 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Casc3Q8K3W3 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Casc3Q8K3W3 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Casc3Q8K3W3 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Casc3Q8K3W3 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Casc3Q8K3W3 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Casc3Q8K3W3 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Casc3Q8K3W3 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Casc3Q8K3W3 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Casc3Q8K3W3 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Casc3Q8K3W3 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Casc3Q8K3W3 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Casc3Q8K3W3 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Casc3Q8K3W3 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Casc3Q8K3W3 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Casc3Q8K3W3 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Casc3Q8K3W3 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Casc3Q8K3W3 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Casc3Q8K3W3 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Casc3Q8K3W3 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Casc3Q8K3W3 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Casc3Q8K3W3 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Casc3Q8K3W3 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Casc3Q8K3W3 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Casc3Q8K3W3 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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